产品介绍PMA是一种高亲和性的DNA结合染料,该染料本身具有微弱的荧光,但与核酸结合后可以发出更为明亮的荧光!它尤其与双链DNA具有高亲和性。PMA不具有细胞膜渗透性,因此可选择性地修饰膜受损的死细胞的DNA.PMA修饰的DNA经蓝光(~464nm)光解后,PMA上的光反应性叠氮基转化为高反应性氮烯自由基,与DNA结合位点附近的任何烃部分反应形成稳定的共价氮碳键,从而导致永,久性DNA修饰(图1)。
将样品曝光,可以使用蓝色或白色光源,照射时间需自行摸索。例如,可用60W的蓝光灯,照射15min.注:①若使用卤素灯,我们建议将PMA处理的样本管放在距离光源20cm处的冰块上。冰块应放在透明托盘中,调整光源使其直接指向样品,光解5-15min;②若直接用环境中获取的细菌进行实验,由于环境样本的复杂性或浑浊度,需适当延长光解时间.注意事项使用前请将产品瞬时离心至管底,再进行后续实验!试剂盒组分中含有荧光染料,使用及保存过程中注意避光!
建议开始PMAqPCR活细菌检测前,先验证引物及PCR程序是否合适!死、活细菌对照dCt计算qPCR结束后,使用仪器软件计算每个样本的Ct值。通过计算每个对照细菌的dCt的方式,判断PMA是否成功抑制了死细菌DNA的扩增,计算如下:dCt活=Ct(活,PMA处理)-Ct(活,PMA未处理)dCt死=Ct(死,PMA处理)-Ct(死,PMA未处理)活细菌的dCt期望值接近于0±1,这表明PMA不会影响活细胞DNA的扩增;死细菌的dCt期望值大于4(dCt为4表示减少了约16倍,即去除了94%的死细菌DNA;dCt为8表示减少了约250倍,即去除了96%的死细菌DNA)!

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该修饰过程会使DNA不溶,并使其在随后的基因组DNA提取过程中与细胞碎片一起丢失,进而阻碍死细胞中目标DNA的PCR扩增!残留在溶液中未结合的PMA,在强光照射下与水分子反应分解成无交联活性的羟胺化合物,使羟胺不再能够共价结合DNA,从而不影响PCR扩增!这个特性使得PMA可以通过实时定量PCR(qPCR)的手段,检测多种样本类型包括:细菌、生物膜、酵母、真菌、病毒和真核细胞;与qPCR、NGS、Sanger测序和LAMP技术相结合,广泛应用在食品和水安全和环境测试中。

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为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作.死细菌的dCt取决于许多因素,包括:菌株系/细胞类型;细菌被杀死方式;PMA使用浓度;扩增序列长度!活细菌占比计算如果死、活细菌对照结果正常,可以进入样本中活细菌占比计算!计算样本的dCt值:转换dCt值为活细菌比例:计算活细菌的绝,对数量dCt样本=Ct(样本,PMA处理)-Ct(样本,PMA未处理)PMA抑制倍数=2(样本dCt)活细菌%=100/PMA抑制倍数如果想计算样本中活细菌的绝,对数量☆,需要用已知数量的目标菌的基因组DNA制作标准曲线!

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