温湿度、土壤及施用时期施用菌肥的佳温度是25℃～37℃，低于5℃，高于45℃，施用效果较差.对高温、低温、干旱条件下的农作物田块不宜施用!固氮菌肥适湿度土壤的含水量是60%～70%！对含硫高的土壤和锈水田，不宜施用菌肥，因为硫能杀死生物菌.对于翻浆的水田，一般不用撒施，用喷雾的方法效果会好些。生物菌肥不是肥，在作物的营养临界期和营养大量吸收期前7~10天施用，效果佳.用量及混用土壤中施入较多的菌肥，虽然不会出现烧根烧苗现象，但也并不是施得越多就越好。

　　大量的有机质通过有益微生物活动后，可不断释放出植物生长所需的营养元素，达到肥效持久的目的。生物菌肥的施用方法有效期及有效活菌数目前我国微生物肥料有效菌存活时间超过1年的不多，所以选购的菌肥要尽快使用，存放时间过长，其菌种的休眠状态可能被破坏.菌肥有效活菌数达不到标准的菌肥不能购买.国家规定微生物菌剂有效活菌数≥2亿/克(颗粒1亿/克)，复合微生物肥料和生物有机肥有效活菌数≥2000万/克！如果达不到这一标准，说明产品质量达不到要求!

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　　微生物拌种剂此类菌肥以草炭作为吸附剂，表面吸附菌肥，在播种或定植前浸泡种子或根部有较好的效果，其原因是菌肥内的微生物提高植物根部吸收营养元素的能力，可使作物增产，并减少部分土传病害的发生。复合生物菌肥除了含有活性微生物外，还含有多种营养物质!有的是有机营养物质和微生物复混配的;有的则是有机物营养物质、无机营养物质和微生物混配的，可提高作物的产量、品质、抗病性，改良土壤理化性质，维持环境平衡。06根际环境保护屏障菌群中的地衣芽孢杆菌等有益微生物施入土壤后，迅速繁殖成为优势菌群，控制根际营养和资源，使重茬、根腐、立枯、流胶、灰霉等病原菌丧失生存空间和条件.

　　凝结芽孢杆菌：可降低环境中的氨气、硫化氢等有害气体.提高果实中氨基酸的含量.米曲霉：使秸秆中的有机质成为植物生长所需的营养，提高土壤有机质，改善土壤结构。淡紫拟青霉：对多种线虫都有防治效能，是防治根结线虫有前途的生防制剂！生物菌肥主要作用三种以上多种复合菌相互促进、相互补充，抗土传病害效果远远大于单一菌种.有益菌群相互协同，共同作用，能使作物达到高产丰产的效果。01促进快速生长菌肥中的微生物在土壤内的生命活动过程中，会产生大量的赤霉素和细胞激素类等物质，这些物质在与植物根系接触后，能调节作物的新陈代谢，刺激作物的生长，从而使作物产生增产效果!

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　　盲目大量施用生物菌肥，会增加肥料投入成本，降低作物的栽培效益!因此，应根据不同作物的需要和土壤养分状况，科学地确定生物菌肥施肥量，才能达到增产增收的目的！菌肥可与化肥混合使用！如过磷酸钙等施入土壤后易被固定，与菌肥混合施用，可减少养分固定、流失!而且单独施用较大量的化肥或化肥施用不均匀时，容易对作物产生毒副作用，如果与菌肥混合施用，则会减少此类问题发生.但不要将菌肥与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫的化肥(如硫酸钾等)以及稻草灰混合用，因为这些药、肥，很容易杀死生物菌！