GC-MS数据采集有机混合物样品用微量注射器由色谱仪进样口注入，经色谱柱分离后进入质谱仪离子原在离子源被电离成离子!离子经质量分析器，检测器之后即成为质谱仪信号并输入计算机！样品由色谱柱不断流入离子源，离子由离子源不断进入分析器并不断得到质谱，只要没定好分析器扫描的质量范围和扫描时间，计算机就可以采集到一个个的质谱!如果没有样品进入离子源，计算机采集到的质谱各离子强度均为0。当有样品过入离子源时，计算机就采集到具有一定离子强度的质谱!

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　　送样时请尽量使用冰盒（泡沫盒+干冰+冰袋），以保证运输过程中的低温条件（干冰的挥发消耗量约为3公斤/天）！在打包时先放入足量的干冰，之后用冰袋填充泡沫盒中间的空隙，为了保持冰盒中的低温环境，建议采用厚一点的泡沫盒!取样建议：纯菌株，提供平板或者15ml菌液宏基因组是指特定环境中全部微生物遗传物质的总和。宏基因组测序以特定环境中的整个微生物群落作为研究的对象，不需对微生物进行分离培养，而是提取环境微生物总DNA进行研究.

　　设置原则是：一般情况下均使用毛细管柱，极性样品使用极性毛细管柱，非极性样品采用非极性毛细管柱，未知样品可先用中等极性毛细管柱，试用后再调整！当然，如果有文献可以参考，就采用文献所用条件！质谱条件包括：电离电压，电子电流，扫描速度，质量范围，这些都要根据样品情况进行设定！为了保护灯绿和倍增器，在设定质谱条件时，还要设置溶剂去除时间，使溶剂峰通过离子源之后再打开灯绿和倍增器.在所有的条件确定之后，将样品用微量注射器注入进样口，同时，启动色谱与质谱，进行GC-MS分析！

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　　此种扫描方式是只针对选定的离子进行检测，而其它离子不被记录.它的优点：一是对离子进行选择性检测，只记录具有特征的、感兴趣的离子，不相关的，干扰离子统统被排除；二是选定离子的检测灵敏度大大提高!在正常扫描情况下，假定一秒钟扫描2～500个质量单位！那么，扫过每个质量所花的时间大约是1/500秒，也就是说，在每次扫描中，有1/500秒的时间是在接收某一质量的离子!在选择离子扫描的情况下，假定只检测5个质量的离子，同样，也用一秒，那么，扫过一个质量所花的时间大约是1/5秒!

　　细菌全基因组检测，是指通过基因组测序和组装获得细菌全基因组序列，并对其进行结构和功能研究的方法.依据研究目标所需精细程度的不同，我们提供了细菌扫描图和完成图两种不同的解决方案.全基因组测序的优略：1，包含微生物的全部遗传信息，相比16S除了分类信息外还有更多的基因信息。2，功能基因研究可以找到特定环境下富集的功能基因.缺点：1，相对靶基因来讲，测序深度低，冗余信息多2，成本高，计算机的要求高，数据分析难度高实验方法：检测平台：二代高通量测序平台，三代高通量测序平台目前的三大数据库：Silva（v119）、RDP、GreenGene！