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  • 更新日期:2022-04-23
产品说明

  细菌全基因组检测,是指通过基因组测序和组装获得细菌全基因组序列,并对其进行结构和功能研究的方法!依据研究目标所需精细程度的不同,我们提供了细菌扫描图和完成图两种不同的解决方案。全基因组测序的优略:1,包含微生物的全部遗传信息,相比16S除了分类信息外还有更多的基因信息.2,功能基因研究可以找到特定环境下富集的功能基因.缺点:1,相对靶基因来讲,测序深度低,冗余信息多2,成本高,计算机的要求高,数据分析难度高实验方法:检测平台:二代高通量测序平台,三代高通量测序平台目前的三大数据库:Silva(v119)、RDP、GreenGene.

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  其摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制,在基因组水平解释微生物群体的多样性和丰度,探索微生物与环境及宿主之间的关系.目前,第二代高通量测序技术在宏基因组的研究上已被广泛应用!第二代高通量测序平台具有通量高、准确性高、速度快、信息全等特点,加快了宏基因组测序在鉴定低丰度的微生物群落,挖掘更多基因资源方面的应用!质谱仪种类很多,不同类型的质谱仪主要差别在于离子源。离子源的不同决定了对被测样品的不同要求,同时,所得信息也不同。

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  也就是说,在每次扫描中,有1/5秒时间是在接收某一质量的离子。因此,采用选择离子扫描方式比正常扫描方式灵敏度可提高大约100倍!由于,选择离子扫描只能检测有限的几个离子,不能得到完整的质谱图,因此,不能用来进行未知物定性分析,但是,如果选定的离子具有很好的特征性,也可以用来表示某种化合物的存在.选择离子扫描方式主要的用途是定量分析,由于它的选择性好,可以把由全扫描方式得到的非常复杂的总离子色谱图变得十分简单。


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  此种扫描方式是只针对选定的离子进行检测,而其它离子不被记录。它的优点:一是对离子进行选择性检测,只记录具有特征的、感兴趣的离子,不相关的,干扰离子统统被排除;二是选定离子的检测灵敏度大大提高!在正常扫描情况下,假定一秒钟扫描2~500个质量单位!那么,扫过每个质量所花的时间大约是1/500秒,也就是说,在每次扫描中,有1/500秒的时间是在接收某一质量的离子。在选择离子扫描的情况下,假定只检测5个质量的离子,同样,也用一秒,那么,扫过一个质量所花的时间大约是1/5秒。


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  设置原则是:一般情况下均使用毛细管柱,极性样品使用极性毛细管柱,非极性样品采用非极性毛细管柱,未知样品可先用中等极性毛细管柱,试用后再调整.当然,如果有文献可以参考,就采用文献所用条件!质谱条件包括:电离电压,电子电流,扫描速度,质量范围,这些都要根据样品情况进行设定.为了保护灯绿和倍增器,在设定质谱条件时,还要设置溶剂去除时间,使溶剂峰通过离子源之后再打开灯绿和倍增器.在所有的条件确定之后,将样品用微量注射器注入进样口,同时,启动色谱与质谱,进行GC-MS分析!

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  送样时请尽量使用冰盒(泡沫盒+干冰+冰袋),以保证运输过程中的低温条件(干冰的挥发消耗量约为3公斤/天)。在打包时先放入足量的干冰,之后用冰袋填充泡沫盒中间的空隙,为了保持冰盒中的低温环境,建议采用厚一点的泡沫盒.取样建议:纯菌株,提供平板或者15ml菌液宏基因组是指特定环境中全部微生物遗传物质的总和!宏基因组测序以特定环境中的整个微生物群落作为研究的对象,不需对微生物进行分离培养,而是提取环境微生物总DNA进行研究.


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  GC-MS数据采集有机混合物样品用微量注射器由色谱仪进样口注入,经色谱柱分离后进入质谱仪离子原在离子源被电离成离子。离子经质量分析器,检测器之后即成为质谱仪信号并输入计算机。样品由色谱柱不断流入离子源,离子由离子源不断进入分析器并不断得到质谱,只要没定好分析器扫描的质量范围和扫描时间,计算机就可以采集到一个个的质谱.如果没有样品进入离子源,计算机采集到的质谱各离子强度均为0。当有样品过入离子源时,计算机就采集到具有一定离子强度的质谱! 一种基于DNA纳米技术的生物传感平台 生物传感器是一类在临床检测、遗传分析、环境检测、生物反恐和国家安全防御等领域具有重要应用的传感器件。最近,中科院上海应用物理所物理生物学实验室和美国亚利桑那州立大学的研究人员合作发展了一种基于DNA纳米技术的三维DNA纳米结构探针,并在此基础上构建了一类新型的生物传感平台,实现了对基因和蛋白质高性能检测。相关论文以封面形式发表于材料领域著名杂志《先进材料》(AdvancedMaterials,2010,22,4754-4758)。



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