- 产品名称:20mM/LPMA标准液品牌_染细胞PMA标准液-20度保存_上海晅科生物科技有限公司
- 产品价格:885.00
- 产品数量:100
- 保质/修期:1
- 保质/修期单位:年
- 更新日期:2022-11-03
阳性对照可以使用活细胞的基因组DNA.为了验证PMA在测试样本中的有效性,可对比同处理样本-/+PMA之间的Ct(dCt)变化!实验材料(自备)光源(用于PMA修饰DNA后的光解步骤)细菌基因组DNA提取试剂盒配套的qPCRMix试剂盒对应样本类型的有效qPCR引物实验步骤吸取10μL菌液于液体LB培养基,在细菌培养箱中培养过夜或更长时间,使细菌培养至对数生长期(OD600≈0);注:培养基类型及培养时间根据实验调整!
该修饰过程会使DNA不溶,并使其在随后的基因组DNA提取过程中与细胞碎片一起丢失,进而阻碍死细胞中目标DNA的PCR扩增。残留在溶液中未结合的PMA,在强光照射下与水分子反应分解成无交联活性的羟胺化合物,使羟胺不再能够共价结合DNA,从而不影响PCR扩增。这个特性使得PMA可以通过实时定量PCR(qPCR)的手段,检测多种样本类型包括:细菌、生物膜、酵母、真菌、病毒和真核细胞;与qPCR、NGS、Sanger测序和LAMP技术相结合,广泛应用在食品和水安全和环境测试中.
建议稀释的几组基因组浓度在qPCR分析体系的范围内!以Ct值为纵坐标,细胞数为横坐标,制作标准曲线。计算实验样本的拷贝数:Ct=斜率*细胞数+y轴截距(y=mx+b)细菌数样本=(Ct–y轴截距)/斜率注:☆纯化过程中活细菌DNA未损失!示例:E!coli(uidA)图活/死大肠杆菌用25μMPMA孵育,然后光解.后提取gDNA,用uidA引物进行扩增。注意事项使用前请将产品瞬时离心至管底,再进行后续实验.
产品介绍PMA是一种高亲和性的DNA结合染料,该染料本身具有微弱的荧光,但与核酸结合后可以发出更为明亮的荧光!它尤其与双链DNA具有高亲和性.PMA不具有细胞膜渗透性,因此可选择性地修饰膜受损的死细胞的DNA.PMA修饰的DNA经蓝光(~464nm)光解后,PMA上的光反应性叠氮基转化为高反应性氮烯自由基,与DNA结合位点附近的任何烃部分反应形成稳定的共价氮碳键,从而导致永,久性DNA修饰(图1)。
试剂盒组分中含有荧光染料,使用及保存过程中注意避光!为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作.DilinoleylDiI(细胞膜橙红色荧光探针)DiD(细胞膜红色荧光探针)DiR(细胞膜近红外荧光探针)CytoMBriteTM细胞膜红色荧光探针CellTrackerCM-DiI(细胞膜橙红色荧光探针)CellTrackerCM-DiI(细胞膜橙红色荧光探针)DiOPlus(细胞膜绿色荧光探针升级款)CytoMBriteTM细胞膜橙红色荧光探针Hoechst33258Hoechst33258染色液(即用型)Hoechst33342Hoechst33342染色液(即用型)DAPI(4,6-二脒基-2-苯,基吲哚二盐酸盐)DAPI染色液(即用型)PropidiumIodide(碘化丙锭,PI)EthidiumHomodimer-I(溴乙啡锭二聚体I,EthD-I)DRAQ5活细胞DNA染料DRAQ5活细胞DNA染料DRAQ5活细胞DNA染料DRAQ7死细胞DNA染料DRAQ7死细胞DNA染料DRAQ7死细胞DNA染料7-AADOxazoleyellow(恶唑黄),1mMinDMSOCalceinAM(钙黄绿素AM)LuciferYellowCada,verine.
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。死细菌的dCt取决于许多因素,包括:菌株系/细胞类型;细菌被杀死方式;PMA使用浓度;扩增序列长度!活细菌占比计算如果死、活细菌对照结果正常,可以进入样本中活细菌占比计算。计算样本的dCt值:转换dCt值为活细菌比例:计算活细菌的绝,对数量dCt样本=Ct(样本,PMA处理)-Ct(样本,PMA未处理)PMA抑制倍数=2(样本dCt)活细菌%=100/PMA抑制倍数如果想计算样本中活细菌的绝,对数量☆,需要用已知数量的目标菌的基因组DNA制作标准曲线.
建议开始PMAqPCR活细菌检测前,先验证引物及PCR程序是否合适。死、活细菌对照dCt计算qPCR结束后,使用仪器软件计算每个样本的Ct值!通过计算每个对照细菌的dCt的方式,判断PMA是否成功抑制了死细菌DNA的扩增,计算如下:dCt活=Ct(活,PMA处理)-Ct(活,PMA未处理)dCt死=Ct(死,PMA处理)-Ct(死,PMA未处理)活细菌的dCt期望值接近于0±1,这表明PMA不会影响活细胞DNA的扩增;死细菌的dCt期望值大于4(dCt为4表示减少了约16倍,即去除了94%的死细菌DNA;dCt为8表示减少了约250倍,即去除了96%的死细菌DNA)。
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